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中路军一部迅速攻占吐鲁番，然后合兵一处，兵锋直指盛世才的老巢迪化。在达坂城，中路军同前来支援吐鲁番守军的省军相遇，双方很快展开激战。6000多省军只坚持了40多分钟，就被中路军包围全歼。随后，中路军包围了迪化，并分兵一部清扫迪化周边的城市。见势不妙的盛世才带着大部分政府人员匆匆逃往塔城，这里有他苏联干爹一个机械化师的驻军，这家伙去哭鼻子去了。
只是盛世才也没想到南疆集团西路军一样开始进攻了，只不过由于天山的阻隔，兵力运输略为迟缓了一点。其实总参谋部早已考虑过这个问题，所以在库车进行支援的大力神运输机就多达800架，新建了一个可同时容纳2000架战机的大型机场和庞大的物资转运中心。23日，西路军全部翻过天山，开始对伊犁地区的征服行动。伊宁的9000多苏军和5000多省军连一天也没有坚持下来就完全落败，溃退人员迅速撤往精河。西路军三万人对伊宁周边地区进行清除，其余七万多人乘胜追击。精河、乌苏、托里顺势而下，西路军一部包围了塔城，其余人马直扑哈巴河、阿勒泰一带，同西进的第一集团军联手控制阿尔泰山南麓地区。
时间推移到25日，此时整个新疆地区只有迪化与塔城还在苏盛联军的控制之下。就这样还是宇行有意为之，否则也就像其它地方一样落入南疆集团手中。这主要是某人不想破坏当地的历史文化遗迹，没有动用什么火炮和战机，这才放了他们一马的。宇行希望能够和平解放迪化和塔城，同时苏军能够主动撤退回国。这个面子问题还是要给斯大林的留的，当然宇行还希望把冲突控制在可接受的范围内。26日，中路军在清剿迪化周边的残军之后，留守迪化的东北义勇军和警察部队放下了武器，打开城门迎接南疆军团进入迪化城。南疆集团暂时保持了迪化的现状，入城的一万多部队只是维持治安、打击犯罪，毕竟现在人心末定，还是让大家安下心来。随即，南疆集团通电全国，迪化和平解放，新疆一统。
退守塔城的盛世才在看到被西路军包围之后，一天几封电报向斯大林求救，塔城的苏军亦不停地向上级反应情况危机。苏联扶持盛世才的目的就是想保持新疆的稳定，这样新疆的局势的变化就与苏联方面关系密切起来。因此，莫斯科面对此事，必然不能坐视不理。不过，局势的迅速恶化更加使得莫斯科当局感到忧虑。对新疆问题的处理意见也分成了两派，一是和平退出，一是武装干涉。由于南北疆战争已经造成了中苏新疆边境的混乱，而苏联由于必须要把主要精力一直放在欧洲，因此绝对不能容忍远东出现任何“动荡”的。再者，盛世才一直紧抱自己大腿，是一个非常好的合作者。想来，南疆势力也不可能比他做的更好。因此，斯大林最终决定武装干涉新疆的战争。
南疆集团对塔城围而不攻其实就是向苏方示好，目前宇行还不想现在就同老毛子干一架。不过，一直到四月底宇行也没有收到苏方的友好表示。从各个方面反馈回来的消息是苏军的频频调动，几天时间就从巴特涌进来两万多苏军。南疆集团总参谋部认为双方已经不可能达成谅解，决定抓紧时间解决境内反对势力，然后组织人员、物资准备应付苏军的进攻。虽然现在塔城已经聚集了三万多苏军和两万多省军，但是在南疆集团强大的军事打击下，最终仅仅坚守了两天时间，就在飞机坦克的攻击下土崩瓦解。躲在苏军军营的盛世才及其亲信被西路军当场活捉，其手下的省军全军覆没。进入新疆的苏军也没有跑掉一个，被南疆军团俘虏了16000多人，其余全部战死。至此，南疆集团才完全统一新疆。
南疆集团总参谋部并没有沉浸在胜利的喜悦中，他们正在研究苏军可能的进攻路径，以期作出合理的兵力安排，争取一棒子把苏军打疼，省得他们一直窥视新疆。不过中苏边境口岸太多，像木札特口岸、巴克图口岸、吉木乃口岸、吐尔尕特口岸、阿拉山口口岸等，还有蒙古边境的乌拉斯台口岸、老爷庙口岸、红山嘴口岸等，几乎把新疆围了一半。那么多的地方都有可能成为苏军进攻的关口，这防守的任务可不是一般的重。
北极熊一直以来对土地都是异常贪婪，自清以来已经从中国掠去上百万平方公里的土地了。民国后，老毛子又借着中国军阀混战之机，扶持乔巴山闹独立，就这样外蒙古在苏联的支持下从中国独立出去，并且其政权为苏联所控制，苏军很可能通过蒙古进入新疆地区。不过，南疆集团一直在乌兰察布盟驻扎有十万外籍兵团，想来阿尔泰山东部地区应该没有什么太大的漏洞。不过，唐努乌梁海的苏军却可以借道科布多从乌拉斯台或者阿勒泰附近入侵新疆。西部边疆的吉木乃、巴克图、阿拉山口、木札特、别迭里、吐鲁噶尔特山口等十多个口岸都有可能是进攻的目标。
最终总参谋部决定在阿勒泰、塔城、博乐、伊宁、乌什、乌恰分别驻扎三万部队，在马纳斯、乌苏、阿克苏、喀什、奇台分别驻兵五万。南北疆分别设立参谋分部，总参谋部设在库尔勒。另外，从地下城开挖的直达喀什、阿克苏的地下通道继续施工，直接建设到乌恰、乌什防线。而到达库车、库尔勒的地下通道将向博乐、迪化延伸，从而形成庞大的地下交通网。分隔南北疆的天山严重阻碍了两地的交通运输，宇行直接动手，从西到东用黑洞炮轰出了四条四公里宽的豁口出来，从阿克苏、库车、库尔勒、吐鲁番到北部地区的道路是一片坦途。至此，南疆集团的准备工作全部安排下去了，现在就等那豺狼犯边受死了。
在宇行看来，以南疆集团现有的实力并不憷此时的苏联。虽然北极熊通过极端国有化改造，国家工业基地建设取得了令人瞩目的成绩。不过，由于宇行在这次经济危机中搅风搞雨，苏联并没有像历史上那样从中获得那么大的利益。因为大部分的机器设备是被宇行购买并转运到中国去了，同时还雇佣了大批资本主义国家的失业人员帮助中国进行工业基地建设。